Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms