Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms