Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp26c1B2RXA7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms