Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms