Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr16A3KMN5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms