Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cavin4A2AMM0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms