Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms