Protein–RNA interactions for Protein: A2A3V1

Akap17b, A-kinase anchor protein 17B, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap17bA2A3V1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Akap17bA2A3V1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Akap17bA2A3V1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms