Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt27Q9Z320 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt27Q9Z320 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms