Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms