Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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