Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C7

Prpf40a, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf40aQ9R1C7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Prpf40aQ9R1C7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Prpf40aQ9R1C7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Prpf40aQ9R1C7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40aQ9R1C7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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