Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphs1Q9QZS7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphs1Q9QZS7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphs1Q9QZS7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphs1Q9QZS7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphs1Q9QZS7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphs1Q9QZS7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphs1Q9QZS7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphs1Q9QZS7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphs1Q9QZS7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphs1Q9QZS7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphs1Q9QZS7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphs1Q9QZS7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphs1Q9QZS7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphs1Q9QZS7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphs1Q9QZS7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphs1Q9QZS7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphs1Q9QZS7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphs1Q9QZS7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphs1Q9QZS7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphs1Q9QZS7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphs1Q9QZS7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphs1Q9QZS7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphs1Q9QZS7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphs1Q9QZS7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphs1Q9QZS7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphs1Q9QZS7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphs1Q9QZS7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphs1Q9QZS7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphs1Q9QZS7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nphs1Q9QZS7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nphs1Q9QZS7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nphs1Q9QZS7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nphs1Q9QZS7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nphs1Q9QZS7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nphs1Q9QZS7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nphs1Q9QZS7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nphs1Q9QZS7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nphs1Q9QZS7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nphs1Q9QZS7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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