Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp21Q9QZL6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms