Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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