Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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