Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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