Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cabp1Q9JLK7 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cabp1Q9JLK7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cabp1Q9JLK7 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cabp1Q9JLK7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cabp1Q9JLK7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cabp1Q9JLK7 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cabp1Q9JLK7 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cabp1Q9JLK7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cabp1Q9JLK7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cabp1Q9JLK7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cabp1Q9JLK7 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cabp1Q9JLK7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cabp1Q9JLK7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cabp1Q9JLK7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cabp1Q9JLK7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cabp1Q9JLK7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cabp1Q9JLK7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cabp1Q9JLK7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cabp1Q9JLK7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cabp1Q9JLK7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cabp1Q9JLK7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cabp1Q9JLK7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cabp1Q9JLK7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cabp1Q9JLK7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cabp1Q9JLK7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cabp1Q9JLK7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms