Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim54Q9ERP3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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