Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rhox9Q9EQM5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rhox9Q9EQM5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rhox9Q9EQM5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rhox9Q9EQM5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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