Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms