Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms