Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Med27Q9DB40 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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