Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Chmp2aQ9DB34 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Chmp2aQ9DB34 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Chmp2aQ9DB34 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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