Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Borcs6Q9D6W8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Borcs6Q9D6W8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Borcs6Q9D6W8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Borcs6Q9D6W8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Borcs6Q9D6W8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms