Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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