Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms