Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms