Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms