Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms