Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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