Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV3

Crygf, Gamma-crystallin F, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygfQ9CXV3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
CrygfQ9CXV3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrygfQ9CXV3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms