Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms