Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms