Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdca4Q9CWM2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdca4Q9CWM2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdca4Q9CWM2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdca4Q9CWM2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdca4Q9CWM2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdca4Q9CWM2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdca4Q9CWM2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdca4Q9CWM2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdca4Q9CWM2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdca4Q9CWM2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdca4Q9CWM2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdca4Q9CWM2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdca4Q9CWM2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdca4Q9CWM2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdca4Q9CWM2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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