Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms