Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms