Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d3Q9CSV6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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