Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms