Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Csde1Q91W50 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csde1Q91W50 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Csde1Q91W50 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Csde1Q91W50 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csde1Q91W50 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csde1Q91W50 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csde1Q91W50 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Csde1Q91W50 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms