Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Smg8Q8VE18 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Smg8Q8VE18 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Smg8Q8VE18 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Smg8Q8VE18 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Smg8Q8VE18 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Smg8Q8VE18 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Smg8Q8VE18 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Smg8Q8VE18 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Smg8Q8VE18 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Smg8Q8VE18 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Smg8Q8VE18 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Smg8Q8VE18 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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