Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms