Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms