Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2D3

Edc3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc3Q8K2D3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edc3Q8K2D3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edc3Q8K2D3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edc3Q8K2D3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc3Q8K2D3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms