Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms