Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH25

Sltm, SAFB-like transcription modulator, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SltmQ8CH25 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SltmQ8CH25 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms