Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbm28Q8CGC6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbm28Q8CGC6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbm28Q8CGC6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbm28Q8CGC6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbm28Q8CGC6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbm28Q8CGC6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbm28Q8CGC6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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