Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Nhlrc3Q8CCH2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Nhlrc3Q8CCH2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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