Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ccser1Q8C0C4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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