Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms